Bon, on va résumer et reprendre.
Tu n'as plus de son dans Itunes mais la carte son fonctionne car tu as du son ailleurs. On peut donc en déduire que la carte son fonctionne et que le matériel n'est pas en cause. Tu as réinstallé Windows Media Player donc les clés que tu as supprimé du registre ont du être réinstallées.
Peux-être te manque t'il un codec qui n'est pas installé ni avec Itunes, ni avec WMP et dont le fonctionnement aurait été altéré lors de tes manipulations ? Si tu utilises un pack de codec, désinstalle-le puis réinstalle-le pour voir.
Quelques pistes de recherches en attendant :

Peux-tu essayer d'ouvrir différents types de fichiers musicaux avec un autre lecteur que Itunes pour voir si tu as du son (exemple, un wav, un mp3, un ogg, etc.). Comme lecteur, tu peux tenter Winamp par exemple.
C'est pour voir si le problème viens de Itunes ou d'un codec. Ouvre un son qui pose problème dans un autre lecteur pour voir s'il se lance.

Pour ce qui est des ralentissements de l'ordinateur, c'est étonnant car s'il n'est pas utilisé, Windows Media player ne devrait pas ralentir la machine.
On pourra voir ça une fois le problème de son résolu.

Tu dis avoir réinstallé Itunes et QuickTime, as tu réinstallé les dernières versions disponibles ? Voir ici :
http://www.apple.com/itunes/download/

Peux-tu essayer les différentes manipulations indiquées sur le site de Apple pour voir si tu trouves quelque chose te permettant de résoudre le problème :
http://docs.info.apple.com/article.html?artnum=93610-fr
Apparemment, il y a une gestion des plug-in dans Itunes, peux-tu les désactiver pour voir si aucun d'entres-eux ne pose problème.

Enfin, n'y a t'il pas une fonction du style "rendre muet" qui serait activé par erreur ?
Tiens nous au courant.